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物理化學(xué)材料高性能解決方案

作者:深圳康匯2020-12-28 11:36:53
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物理化學(xué)材料高性能解決方案

21世紀(jì)以來(lái),計(jì)算模擬已經(jīng)成為了與實(shí)驗(yàn)方法、理論方法同樣重要的研究手段,在物理化學(xué)過(guò)程研究等方面起到了越來(lái)越重要的作用。利用高性能計(jì)算機(jī),科研人員不僅可以研究當(dāng)前實(shí)驗(yàn)條件下無(wú)法實(shí)現(xiàn)的各類物理化學(xué)過(guò)程,而且可以從理論層面上對(duì)實(shí)驗(yàn)觀測(cè)的結(jié)果進(jìn)行更加深入的分析。在材料領(lǐng)域,計(jì)算模擬可以取代一些投入高、周期長(zhǎng)的實(shí)驗(yàn)研究,從而大幅度降低研發(fā)投入的人力、物力成本,顯著加快研發(fā)周期。曙光高性能計(jì)算機(jī)在物理化學(xué)材料領(lǐng)域有著廣泛應(yīng)用,針對(duì)于各類計(jì)算的運(yùn)行特點(diǎn),提供最優(yōu)的計(jì)算平臺(tái),加快計(jì)算模擬的計(jì)算速度,成為科學(xué)研究中的強(qiáng)大工具。

物理化學(xué)材料高性能解決方案(圖1)

計(jì)算性能強(qiáng)

提供強(qiáng)大計(jì)算性能,大幅加速計(jì)算模擬速度,實(shí)現(xiàn)更高通量計(jì)算。

物理化學(xué)材料高性能解決方案(圖2)

精準(zhǔn)應(yīng)用適配

豐富的計(jì)算設(shè)備,精準(zhǔn)適配物理化學(xué)應(yīng)用需求,提供優(yōu)化的計(jì)算平臺(tái)。

物理化學(xué)材料高性能解決方案(圖3)

專業(yè)技術(shù)支持

曙光有一支具有豐富的調(diào)優(yōu)經(jīng)驗(yàn)的高性能計(jì)算團(tuán)隊(duì),有多名物理化學(xué)背景博士,提供專業(yè)技術(shù)支持。

方案架構(gòu)

物理化學(xué)材料高性能解決方案(圖4)

為滿足物理化學(xué)應(yīng)用對(duì)高性能計(jì)算的需求,曙光推薦采用如下解決方案。

計(jì)算系統(tǒng):曙光深入分析了物理化學(xué)應(yīng)用運(yùn)行特點(diǎn)和計(jì)算需求,選擇針對(duì)性的計(jì)算設(shè)備加速模擬計(jì)算過(guò)程。集群配置了廣泛應(yīng)用的TC4600E刀片計(jì)算平臺(tái),具有高性能、高密度特點(diǎn)。除廣泛應(yīng)用的intel平臺(tái),曙光針對(duì)于第一性原理計(jì)算內(nèi)存帶寬敏感的運(yùn)行特點(diǎn),配置了基于多核計(jì)算平臺(tái),核心多,內(nèi)存帶寬大,更加適合第一性原理高通量計(jì)算。

存儲(chǔ)系統(tǒng):為了應(yīng)對(duì)高通量計(jì)算產(chǎn)生的海量數(shù)據(jù),曙光高性能集群配置了Parastor分布式并行存儲(chǔ)系統(tǒng)。Parastor支持海量數(shù)據(jù),在線擴(kuò)容,存儲(chǔ)容量和聚合帶寬同步提升,滿足了高通量計(jì)算對(duì)存儲(chǔ)系統(tǒng)的需求。

網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng):曙光為高性能集群配備了高帶寬低延遲的Infiniband或Omni-Path等高速網(wǎng)絡(luò),滿足了物理化學(xué)中各類MPI程序數(shù)據(jù)交換需求,提高了多節(jié)點(diǎn)并行效率,加快了模擬計(jì)算過(guò)程。

軟件系統(tǒng):曙光Gridview集群管理系統(tǒng),提供統(tǒng)一監(jiān)控管理和作業(yè)調(diào)度,支持高通量任務(wù)實(shí)時(shí)調(diào)度,提高計(jì)算資源利用率。提供完整的高性能計(jì)算運(yùn)行環(huán)境,并針對(duì)物理化學(xué)應(yīng)用特點(diǎn)進(jìn)行編譯和運(yùn)行調(diào)優(yōu)。

運(yùn)維服務(wù):曙光EasyOP在線運(yùn)維為高性能集群7*24小時(shí)在線運(yùn)維服務(wù),保障了集群良好的運(yùn)行狀態(tài),將科研人員從繁瑣的集群管理工作中解放出來(lái),投入更多的時(shí)間到實(shí)際的科研過(guò)程中。

物理化學(xué)材料高性能解決方案(圖5)