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生物信息領(lǐng)域高性能計算解決方案

作者:深圳康匯2020-12-28 11:34:06
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生物信息領(lǐng)域高性能計算解決方案

借助飛速發(fā)展的測序技術(shù),全球基因組的數(shù)據(jù)正以超摩爾比的速度增長,每天將產(chǎn)生TB級的測序數(shù)據(jù),同時給生物信息分析帶來了嚴峻的挑戰(zhàn),尤其是數(shù)據(jù)分析中對計算資源和可靠存儲的需求巨大。曙光深耕高性能計算二十余載,依托在生物信息領(lǐng)域積累的豐富經(jīng)驗,為生物信息用戶提供全方位解決方案,為臨床醫(yī)學(xué)和基礎(chǔ)科學(xué)研究提供有力技術(shù)支撐。

生物信息領(lǐng)域高性能計算解決方案(圖1)

高性能

滿足海量測序數(shù)據(jù)的快速分析處理及存儲需求。

生物信息領(lǐng)域高性能計算解決方案(圖2)

易用易管理

為用戶提供簡單易用的使用和維護接口,全方位便捷服務(wù)。

生物信息領(lǐng)域高性能計算解決方案(圖3)

案例豐富

中科院北京基因組研究所、首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京天壇醫(yī)院、鄭州煙草研究院等。

方案架構(gòu)

生物信息領(lǐng)域高性能計算解決方案(圖4)

基于生物信息分析在高性能計算中的需求特性,曙光為用戶提供完整的軟硬一體化解決方案,包括面向組學(xué)分析的高性能計算集群、面向組學(xué)測序數(shù)據(jù)的海量存儲及備份系統(tǒng)、面向臨床及科研的組學(xué)生物信息分析的先進計算平臺,以及面向集群管理的Gridview集群管理軟件和EasyOP在線運維平臺。

基礎(chǔ)設(shè)施:基于第四代數(shù)據(jù)中心標準,提供CloudBase機房基礎(chǔ)設(shè)施整體解決方案整體解決方案,包含池級、排級、機柜級等多系列解決方案,支持配套最先進的冷板式或者浸沒式液冷散熱方式,為相關(guān)軟硬件設(shè)施提供穩(wěn)定可靠、綠色節(jié)能的運行環(huán)境;

硬件資源:基于不同客戶多樣化的需求,曙光為客戶提供多種類型的計算服務(wù)器,包括刀片計算服務(wù)器、雙路計算服務(wù)器、四路或八路服務(wù)器及GPU服務(wù)器,同時為應(yīng)對海量測序數(shù)據(jù)的存儲需求,曙光高性能集群配置了Parastor分布式并行存儲系統(tǒng)。Parastor支持海量數(shù)據(jù),在線擴容,存儲容量和聚合帶寬同步提升。曙光為客戶提供高性能、高可靠的生物信息分析硬件環(huán)境。

管理軟件層:曙光為用戶提供操作系統(tǒng)、編譯器、并行程序開發(fā)環(huán)境、模式和并行編程框架、數(shù)學(xué)庫等。曙光Gridview集群管理軟件具有集群監(jiān)控、系統(tǒng)管理和作業(yè)調(diào)度等多種功能,在提高計算資源利用率的同時也提升了用戶集群使用的效率。

服務(wù)平臺:曙光EasyOP在線運維為高性能集群7*24小時在線運維服務(wù),涵蓋集群遠程運維、現(xiàn)場巡檢、應(yīng)用級技術(shù)支持服務(wù),保障了集群良好的運行狀態(tài)。曙光先進計算服務(wù)平臺摒棄了傳統(tǒng)軟硬件的簡單拼接服務(wù)模式,采用“互聯(lián)網(wǎng)+”服務(wù)模式,為用戶提供兼容的先進計算交付服務(wù),及時、全面的運維管理服務(wù),提供更完善的解決方案和在線支持端口,增加各種新功能將大大改善用戶體驗。

生物信息領(lǐng)域高性能計算解決方案(圖5)